При списании в пределах норм естественной убыли товаров, при приобретении которых был сформирован налоговый кредит и которые потеряли товарный вид, налоговые обязательства плательщиком НДС не начисляются (при условии, что стоимость таких товаров включается в стоимость готовой продукции, которая подлежит налогообложению).
В других случаях — НДС начисляется по основной ставке. Если такие товары списываются сверх норм их естественной убыли, в связи с чем они не могут быть использованы в рамках хозяйственной деятельности плательщика НДС, то не позднее последнего дня отчетного (налогового) периода, в котором происходит их списание, плательщик налога должен осуществить начисление налоговых обязательств по НДС по основной ставке. База налогообложения при списании таких ТМЦ определяется исходя из стоимости их приобретения.