Налогоплательщик может платить суммы пени отдельным платежным документом или одним платежным документом, вместе с денежным обязательствам.
Так, в соответствии со ст. 131 Налогового кодекса Украины (НКУ), при погашении суммы налогового долга (его части) средства, которые платит такой налогоплательщик, в первую очередь зачисляются в счет налогового обязательства. В случае полного погашения суммы налогового долга средства, которые платит такой налогоплательщик, в следующую очередь зачисляются в счет погашения штрафов, в последнюю очередь зачисляются в счет пени.
Если налогоплательщик не выполняет установленной настоящим пунктом очередности платежей или не определяет ее в платежном документе (или определяет с нарушением указанного порядка), контролирующий орган самостоятельно осуществляет распределение такой суммы в определенном порядке.
Следовательно, налогоплательщик может уплачивать суммы пени отдельным платежным документом или одним платежным документом, вместе с денежным обязательствам.
Подробнее об этих и других нюансах налогового законодательства можно узнать по сайте ГФС в рубрике "ОИР" - общедоступный информационный ресурс.